Problema înfiinţării Parchetului European face obiectul articolului 86 alin.(1) din Tratatul privind Funcţionarea Uniunii Europene, potrivit căruia pentru combaterea infracţiunilor care aduc atingere intereselor financiare ale Uniunii, Consiliul poate institui un Parchet European, pornind de la Eurojust, însă numai după aprobarea Parlamentului European. S-a exprimat opinia că marea noutate a Capitolului IV TFUE este articolul 86 care introduce posibilitatea instituirii unui Parchet European, plecând de la Eurojust.